无形资产的理论基础研究和组织建设尚需提升。例如，对无形资产的定义、内涵与外延的定义、归类特点等还存有着“三特点说”、“八特点说”等不一样见解;在商誉会计中，法律学、社会经济学和财务会计行业均对信誉的定义明确提出了不一样的定义;在自创信誉和负商誉的确定与计量中，自创信誉应否确定、可否计量这些仍存有不一样叫法。在操作过程全过程中，关键有下列好多个难题：
一是对无形资产的计量和结转管理体系有悖财务核算的普遍性和时效性标准。以自创商称为例，在我国现行标准的企业会计准则要求，企业信誉仅有在企业企业并购主题活动和实生物给予确定，其金额是买家企业所付款的所有合同款超出卖家企业或被合拼企业资产总额账面价值价钱的差值。企业平常不计量信誉，在企业并购时才对信誉开展计量的作法背驰了财务核算的基本准则，造成财务信息的比较严重失帧。另外，自创无形资产与购买无形资产的入帐方式不一样，造成无形资产中间帐面价值不一样，但现行标准的财务核算企业对自创无形资产以简单方式开展结转，显而易见已不适合局势发展趋势的必须。除此之外，无形资产获得前产生的研发支出是记入企业本期的管理花费的，这便会减少本期的盈利水准，危害企业的生产运营业绩考核，不利鼓励企业和员工进行自主创新。
二是政策方针要求对无形资产的评估值与认缴出资额中间的关联定义不一样。《中国冶金报》发布的《企业改制评估增值的认定处理方式应统一》(详细二0一二年4月27日A3版)一文，将与改革评估有关的各种各样要求开展了集中化核对，从这当中能够看得出有关部门在定义上的差别与不一样。国有资本管控组织 觉得应将财产的评估值所有做为公司股东的注资，《公司法》的有关描述也适用这种作法，但税收单位觉得应以财产评估值扣减企业所得税后的一部分做为公司股东的注资。
三是在企业改革的操作过程阶段，验资报告组织 、公司股东、工商局管理等单位对无形资产的了解和处理方法不尽相同。另外，无形资产的评估升值一部分存有着改革企业和投资人不在另外点交纳企业所得税的状况，这在一定水平上存有着双向缴税的难题。之上不一样和从而产生的组织建设不标准、操作流程不一致，给统一和加强无形资产管理产生了不良影响。在这些方面，有关部门和企业要产生规范性的定义规范和相对的管理规章制度，逐渐保证无形资产管理有形化化。
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